常规的数据恢复因为他们都有一个前提，就是数据没有被覆盖。对于已经被覆盖的数据、完全低格、全盘清零、强磁场破坏的硬盘，仍然有最终极的数据恢复方式，叫“深层信号还原”。具体的原理比较复杂，但是可以通过一个相关的例子来说明。譬如一个人开车撞了人，跑掉了，为了逃避公安的侦查，他把汽车撞过凹陷的地方重新鼓起拉直，并喷上了新的油漆。那么，这样处理过的车子，在肉眼的观察下是看不出碰撞过的痕迹的。但是鉴证科的人只需要用弧光灯照射汽车，戴上专门的偏光镜去看，碰撞过的痕迹就马上一目了然。“深层信号还原”应用了与此类似的原理。从硬盘磁头的角度来看，同样的数据，拷贝进原来没有数据的新盘和拷贝进旧盘去覆盖掉原有数据，是没有分别的，因为这时候磁头所读取到的数字信号都是一样的。但是对于磁介质晶体来说，情况就有点不一样了，以前的数据虽然被覆盖了，但在介质的深层，仍然会留存着原有数据的“残影”，通过使用不同波长、不同强度的射线对这个晶体进行照射，可以产生不同的反射、折射和衍射信号，这就是说，用这些设备发出不同的射线去照射磁盘盘面，然后通过分析各种反射、折射和衍射信号，就可以帮助我们“看到”在不同深度下这个磁介质晶体的残影。根据目前的资料，大概可以观察到4～5层，也就是说，即使一个数据被不同的其他数据重复覆盖4次，仍然有被“深层信号还原”设备读出来的可能性。当然，这样的操作成本无疑是非常高的，也只能用在国家安全级别的用途上，目前世界范围内也没有几个国家可以拥有这样的技术，只有极少数规模庞大的计算机公司和不计成本的政府机关能拥有这样级别的数据恢复设备，而且主要都是由美国人掌握。